柯南最近的心情不太好……
帝丹学园祭上，虽然他吃了灰原哀开发出来的暂时性解药而变大了，但是却连跟兰一句话的机会都没有，药效到头，再度变折磨得他苦不堪言，兰对他的漠视更是让柯南心碎。
不过……一直顺风顺水，一旦遇到问题就只会怨天尤人的大侦探也不想想，到底是谁为了案子而一再忽略兰，让兰伤心的……不过，要不是兰对工藤新一伤透了心，鸣人想要追到兰也不是那么容易的事情。
还好，柯南毕竟足够坚强，加上有好基友服部平次在旁鼓励，柯南也逐渐恢复过来，关东关西的名侦探联手，最近在东京倒是破了几件案子，让柯南的自信心又回来了。
和叶最近的心情比较复杂……
她和平次是一起来东京的，在来东京之前，自己的妈妈还叫平次要好好照顾自己，虽然和叶自己自认为根本不需要平次照顾，但是平次来了东京之后就不见人了，整天去找柯南，和叶会不郁闷吗？
这个时候就是某人趁虚而入的时候了，还好鸣人这两天一直都在陪和叶玩，东京铁塔，多罗比亚乐园，让和叶一边开心玩耍一边吐槽某人的同时，将自己的青梅竹马完全丢在了脑后。
鸣人最近的心情很不错……
和兰恋情揭露之后也不需要藏着掖着了，在帝丹出现的次数也增加了，而在没事做的时候，就陪和叶玩耍斗嘴，虽然他整天都在气和叶，但是对于和叶住在他家，鸣人还是非常高兴的，反正吃亏的人又不会是他。
最近的日子鸣人过得很平静，也很开心，但是，有些人注定是不甘平静的。
东京国立微生物研究所……
这是东京最大的微生物研究所，虽然研究所是十年前才建造的，但是研究所里的研究成果，大部分都是从二战时候遗留下来的，里面也包括了一些非常危险的生物。
两个在外面望风，剩下五个人的武装组入侵了这个微生物研究所，全副武装，防化服，防毒面罩，可以保护工作做得非常全面。
“把门打开！”
其中一个歹徒用枪指着研究所的研究员，可怜的孩子，今天值班就遇上了这种事情。
“是……知道了。”
可怜的研究院颤抖着手输入了密码，然后按上了自己的指纹。
通往细菌保管室的电梯门打开，五个歹徒来到了细菌保管室，看着存放在柜子上，装在试管中，散发着绿色荧光的杀人细菌，面具之下的脸全都露出了诡异的笑容。
轰！！！！
就在歹徒离开之后不到五分钟的时间，整个微生物研究所就发生了巨大的爆炸，歹徒安装的高爆炸弹将整个研究所完全炸毁，包括地下室的部分，所有建筑部分全部摧毁，一切都在烈火中化为了灰烬，而因为这件大案，东京警视厅立刻召开了记者招待会。
“今天晚上21点50分，位于西摩多市的国立东京微生物研究所被人武装集团袭击了。歹徒杀死了两名警备员，绑架了值班的研究员，侵入高度安全实验室，几分钟后，引爆了设置在室内的塑胶炸弹并且逃走，研究所的所有人员全部死亡。在被入侵的实验室里保管着一种高度危险的细菌，可以推测已经被犯罪团伙带走。”
“危险的细菌？”
“那是一种一旦感染，死亡率超过80%的超级细菌，目前还没有治疗的方法。”其实也就是二战生化武器的遗留品。
“警官，研究所爆炸了，是不是意味着细菌已经泄露？”
“那并没有。
”头顶没毛的宇野忠义警官否定了这一点，道：“因为爆炸的威力很大，所以研究所所长的证词表明，就算有细菌残留也应该被完全烧殆尽。”
“那么犯罪团伙的目的是什么？”
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